Natrijum perjodat, bijeli kristalni prah, rastvorljiv u vodi, sirćetnoj kiselini, hlorovodoničkoj kiselini, sumpornoj kiselini, azotnoj kiselini, nerastvorljiv u etanolu. Natrijum perjodat je bijeli četverougaoni kristal koji se može otopiti u vodi i kiselini. Sadrži nečistoće u tragovima kao što su slobodna kiselina, hlorid, bromid, sulfat i teški metali. Može se rafinirati rekristalizacijom iz vodenog rastvora. Ova vrsta materijala ima jake oksidacijske performanse. Iako ne gori sam, pod određenim uvjetima, tvari koje su podložne trenju, vibracijama i udaru, visoke topline ili kiseline i lužine mogu se razgraditi, izgorjeti i eksplodirati kada su izložene vlazi, organskim tvarima, redukcijskim agensima i tvarima koje se nespojivo sa prirodom. Natrijum perjodat ima dve glavne upotrebe u organskoj sintezi: kao oksidans i katalizator. Zbog rastvorljivosti, reakcija oksidacije natrijum perjodata se uglavnom odvija u vodi. Pošto su mnoge organske hemijske knjige nerastvorljive u vodi, neophodno je koristiti korastvarač. Kada postoji katalizator faznog prenosa ili se natrijum perjodat stavlja na inertni nosač, reakcija oksidacije se takođe može izvesti u dvofaznom sistemu.
Natrijum perjodat ima dve glavne upotrebe u organskoj sintezi: s jedne strane, koristi se kao oksidans; S druge strane, koristi se kao katalizator. Reakcija oksidacije natrijum perjodata odvija se u vodi, ali za organske materije, on je nerastvorljiv u vodi, pa treba koristiti korastvarač. Kada se u dvofaznom rastvoru nalazi katalizator faznog prenosa sastavljen od kvaternarne amonijumove soli, ili postoji inertni nosač na površini oksidansa, može doći i do reakcije oksidacije.
Kao opšti oksidans, natrijum perjodat može oksidirati alkohole u karbonilna jedinjenja (Formula 1, Formula 2)

Natrijum perjodat se takođe može koristiti za razbijanje glikolnih jedinjenja i oksidaciju u dikarbonilna jedinjenja (Formula 3, Formula 4)

Natrijum perjodat čak razbija C=C dvostruku vezu i oksidira je u karbonilna jedinjenja. Zove se poznati Lemieux-Johnsonov reagens (formula 6) kada se kombinuje sa OsO4 za oksidaciju alkena. Osim toga, njegovi redukcijski proizvodi mogu se ponovo koristiti perjodatnom oksidacijom.
(Formula 5)

Selektivna oksidacija sulfida u sulfoksid je vrlo važna reakcija, jer je sulfoksid vrlo važan međuprodukt u organskoj sintezi. Može da reaguje sa natrijum perjodatom u rastvoru metanola na 0 oC. Sulfid će se oksidirati u sulfon na visokoj temperaturi ili dodavanjem prekomjerne količine natrijum perjodata. Kada postoji kisela glinica ili silika gel, natrijum perjodat može selektivno oksidirati sulfid u sulfoksid (visok prinos se može postići na sobnoj temperaturi) (Formula 7, Formula 8). Učešće katalizatora faznog prijenosa također čini sulfid selektivno oksidiranim u sulfoksid (Formula 9)

Osim toga, natrijum perjodat se može koristiti kao jeftin katalizator za sintezu sulfoniranja aril grupa (Formula 10).

Reakcioni uslovi su veoma blagi, prinos je visok, vreme reakcije je kratko, a selektivnost je dobra.

