Kako IPTG prah utiče na ekspresiju proteina sa različitim načinima upotrebe kodona?

Hej tamo! Kao anIPTG prahdobavljač, bio sam do koljena u svijetu ekspresije proteina. Na ovom blogu želim razgovarati o tome kako IPTG prah utječe na ekspresiju proteina s različitim načinima korištenja kodona.

Iptg Powder

Šifra proizvoda: BM-2-5-133
Naziv: Iptg
CAS broj: 367-93-1
MF: C9H18O5S
MW: 238,3
EINECS br.: 206-703-0
Tržište: Indonezija, Velika Britanija, Novi Zeland, Kanada itd.
Proizvođač: BLOOM TECH Guangzhou Factory
Tehnološka služba: R&D Dept.-4
Dostava: Dostava kao još jedno ime bez osjetljivog kemijskog spoja.

 

Prvo, hajde da brzo pređemo na ono što je IPTG. IPTG, ili izopropil β-D-1-tiogalaktopiranozid, je dobro poznata hemikalija u oblasti biotehnologije. To je analog alolaktoze, koja je prirodni induktor lac operona. Jednostavno rečeno, može uključiti gene odgovorne za proizvodnju proteina u određenim bakterijama, poput Escherichia coli.

 

Sada, kada je u pitanju ekspresija proteina, upotreba kodona igra veliku ulogu. Različiti organizmi imaju svoje preferencije za koje kodone (skupovi od tri nukleotida) koriste za kodiranje aminokiselina. Na primjer, neki organizmi mogu koristiti određeni kodon za određenu aminokiselinu češće od drugih.

Počnimo gledajući visokofrekventne kodone. Proteini kodirani genima sa visokofrekventnim kodonima općenito se lakše izražavaju. Kada uvedemo IPTG prah u bakterijski sistem koji eksprimira takve proteine, proces može ići zaista glatko. IPTG se vezuje za represorski protein lac operona, oslobađajući ga iz operaterske regije. Ovo omogućava RNA polimerazi da se veže za promotor i počne transkribovati gene koji kodiraju protein.

 

Kod bakterija poput E. coli, koje su vrlo česte u sistemima ekspresije proteina, ribosomi brzo prepoznaju gene sa visokofrekventnim kodonima. Ribozomi mogu efikasno prevesti mRNA u protein. Kada dodamo IPTG, u osnovi dajemo bakterijama zeleno svjetlo da započnu ovaj proizvodni proces brzim tempom. Dakle, za proteine ​​sa visokofrekventnom upotrebom kodona, IPTG prah može dovesti do visokog nivoa i efikasne ekspresije proteina.

 

Ali šta je sa niskofrekventnim kodonima? Ovdje stvari postaju malo složenije. Ribozomi u bakterijskom domaćinu možda neće tako lako prepoznati gene s niskofrekventnim kodonima. Kada se doda IPTG da indukuje ekspresiju proteina sa niskofrekventnim kodonima, ribozomi mogu stati tokom translacije. To je zato što im je teže pronaći odgovarajuće tRNA (transferne RNA) koje nose odgovarajuće aminokiseline za te niskofrekventne kodone.

Kao rezultat toga, ukupni nivo ekspresije proteina može biti niži u poređenju sa proteinima sa visokofrekventnim kodonima. Ponekad možemo čak vidjeti nepotpune ili pogrešno savijene proteine. Zastoj ribozoma također može uzrokovati stres na bakterijskim stanicama, što može dovesti do smanjenog rasta i održivosti stanica.

Da bismo prevazišli ove probleme, možemo koristiti neke trikove. Jedan pristup je ko-ekspresija gena tRNA koji prepoznaju niskofrekventne kodone. Ovo može pomoći u snabdijevanju ribozoma potrebnim tRNA, omogućavajući efikasniju translaciju. Druga opcija je optimizacija same sekvence gena. Kodone niske frekvencije možemo zamijeniti visokofrekventnim kodonima koji kodiraju istu aminokiselinu. Ovaj proces se naziva optimizacija kodona.

Kada je u pitanju naš IPTG prah, pobrinuli smo se da bude vrhunskog kvaliteta. Naši kupci su prijavili odlične rezultate u svojim eksperimentima ekspresije proteina. Bilo da se radi o proteinima sa visokofrekventnim ili niskofrekventnim kodonima, naš IPTG može efikasno inducirati proces ekspresije.

Sada, dozvolite mi da vam predstavim neke druge zanimljive hemijske proizvode sa kojima se bavimo. Check outHalofuginon hidrobromid. Ima neka jedinstvena svojstva i potencijalne primjene u polju istraživanja. i takođe,Estron prah CAS 53-16-7je još jedan proizvod na koji naši istraživači imaju oko. I mi takođe imamo(4S,5R)-(-)-4-METIL-5-FENIL-2-OKSAZOLIDINON CAS 16251-45-9koji bi mogao biti vrijedan dodatak vašem istraživačkom materijalu.

Dakle, ako ste uključeni u istraživanje ekspresije proteina ili trebate visokokvalitetne kemikalije za svoje eksperimente, ne oklijevajte da nam se obratite za raspravu o kupovini. Tu smo da vam pomognemo da postignete najbolje rezultate sa našim proizvodima.

[1] Studier, FW, & Moffatt, BA (1986). Upotreba bakteriofaga T7 RNA polimeraze za usmjeravanje selektivne ekspresije kloniranih gena na visokom nivou. Journal of Molecular Biology, 189(1), 113-130.
[2] Gustafsson, C., Govindarajan, S., & Minshull, J. (2004). Kodon bias i heterologna ekspresija proteina. Trends in Biotechnology, 22(7), 346-353.